• آخرین
  • روند
  • همه
نانودراپ

آشنایی با دستگاه نانودراپ و اصول کار با آن

آبان 22, 1400
تکنیک کریسپر

تکنیک کریسپر

اردیبهشت 30, 1401
رومانوف

پیدا کردن اعضای خاندان رومانوف با بررسی STR های استخوان های خانواده سلطنتی

اردیبهشت 19, 1401
استخراج DNA با پروتئیناز K

استخراج DNA با پروتئیناز K

اردیبهشت 14, 1401
طراحی پرایمر

راهنمای جامع طراحی پرایمر

اردیبهشت 10, 1401
تکنیک SDS-PAGE

تکنیک SDS-PAGE

اردیبهشت 15, 1401
روز جهانی DNA

روز جهانی DNA

اردیبهشت 5, 1401
استخراج DNA به روش Salting Out

استخراج DNA به روش Salting Out

اردیبهشت 15, 1401
روز علوم آزمایشگاهی

روز علوم آزمایشگاهی؛ زاد روز حکیم اسماعیل جرجانی

فروردین 29, 1401
روز جهانی هموفیلی

روز جهانی هموفیلی

فروردین 27, 1401
استخراج DNA به روش فنل کلروفورم

استخراج DNA به روش فنل کلروفرم

اردیبهشت 15, 1401
کارآموزی ژنتیک مولکولی

کارآموزی ژنتیک مولکولی

اردیبهشت 10, 1401
استخراج DNA

مروری بر انواع روشهای استخراج DNA

اردیبهشت 14, 1401
دست نوشته های سرقت شده داروین

بازگشت دست نوشته های سرقت شده داروین به کمبریج پس از 22 سال

فروردین 18, 1401
ذخایر ژنتیکی و زیستی

ذخایر ژنتیکی و زیستی، گنجینه ی ملی ایران

فروردین 15, 1401
سنترال دگما

سنترال دگما، اصل مرکزی زیست شناسی مولکولی

اسفند 24, 1400
ژل داک

دستگاه ژل داک یا مستندساز ژل و انواع آن

بهمن 11, 1400
  • وبسایت داروینو
  • درباره ما
  • تماس با ما
شنبه, اردیبهشت 31, 1401
  • ورود
  • ثبت نام
لوگوی وبلاگ داروینو
  • صفحه اصلی
  • بلاگ
    • همه
    • بیوانفورماتیک
    • بیوتکنولوژی
    • پزشکی و داروسازی
    • ژنتیک
    • علوم آزمایشگاهی
    • کشت سلول و بافت‌شناسی
    • میکروبیولوژی
    تکنیک کریسپر

    تکنیک کریسپر

    رومانوف

    پیدا کردن اعضای خاندان رومانوف با بررسی STR های استخوان های خانواده سلطنتی

    استخراج DNA با پروتئیناز K

    استخراج DNA با پروتئیناز K

    طراحی پرایمر

    راهنمای جامع طراحی پرایمر

    تکنیک SDS-PAGE

    تکنیک SDS-PAGE

    استخراج DNA به روش Salting Out

    استخراج DNA به روش Salting Out

    استخراج DNA به روش فنل کلروفورم

    استخراج DNA به روش فنل کلروفرم

    کارآموزی ژنتیک مولکولی

    کارآموزی ژنتیک مولکولی

    استخراج DNA

    مروری بر انواع روشهای استخراج DNA

    سنترال دگما

    سنترال دگما، اصل مرکزی زیست شناسی مولکولی

    برچسب های پرطرفدار

    • داروینو پلاس
      • همه
      • بوم‌گردی
      • خبرهای علمی و پزشکی
      • معرفی دستگاه ها و تجهیزات آزمایشگاهی
      • معرفی سایت و نرم افزار
      • معرفی شخصیت و آزمایشگاه
      • معرفی شرکت های معتبر
      • معرفی فیلم و کتاب
      • مناسبت‌ها
      روز جهانی DNA

      روز جهانی DNA

      روز علوم آزمایشگاهی

      روز علوم آزمایشگاهی؛ زاد روز حکیم اسماعیل جرجانی

      روز جهانی هموفیلی

      روز جهانی هموفیلی

      دست نوشته های سرقت شده داروین

      بازگشت دست نوشته های سرقت شده داروین به کمبریج پس از 22 سال

      ذخایر ژنتیکی و زیستی

      ذخایر ژنتیکی و زیستی، گنجینه ی ملی ایران

      ژل داک

      دستگاه ژل داک یا مستندساز ژل و انواع آن

      نرم افزار Oligo 7

      َآنالیز و طراحی پرایمر با نرم افزار Oligo 7

      پیوند قلب خوک به انسان

      پیوند قلب خوک به انسان با استفاده از تکنیک کریسپر

      سانتریفوژ

      انواع سانتریفوژها و کاربرد آنها

      طراحی پرایمر با نرم افزار gene runner

      طراحی پرایمر با نرم افزار gene runner

      برچسب های پرطرفدار

      بدون نتیجه
      مشاهده همه نتیجه
      وبلاگ داروینو
      بدون نتیجه
      مشاهده همه نتیجه
      صفحه نخست بلاگ

      آشنایی با دستگاه نانودراپ و اصول کار با آن

      توسط مدیر سایت
      آبان 22, 1400
      در بلاگ, ژنتیک, معرفی دستگاه ها و تجهیزات آزمایشگاهی
      1 0
      0
      نانودراپ

      اندازه گیری غلظت DNA و RNA با دستگاه نانودراپ

      برای مراکز تحقیقاتی و تشخیصی که تقاضای بالایی برای تجزیه و تحلیل کیفیت نمونه ها دارند، این دستگاه یک راه حل مقرون به صرفه است و با استفاده از آن، در مدت زمان بسیار کوتاهی با حجم بسیار کم از نمونه نتایج را می توان بدست آورد.

      نانودراپ، اسپکتروفتومتر بدون نیاز به کووت است و تنها با استفاده از 1 الی 2 میکرولیتر از نمونه قادر است در زمانی کمتر از 10 ثانیه کلیه طول موج های موجود در طیف مورد نظر را با دقت 1 نانومتر، اسکن نماید و غلظت یا جذب نوری ماده مورد نظر را نیز تعیین کند.

      از سال 2001، بیش از 35000 ابزار NanoDrop در آزمایشگاه‌های دانشگاهی، تحقیقاتی، تجاری و QC با تمرکز در زمینه‌های متنوعی مانند ژنومیک، پروتئومیکس، کشف دارو، تشخیص مولکولی و تولید زیستی مورد استفاده قرار گرفته‌ است. این سیستم به دانشمندان اجازه می دهد تا به سرعت و به راحتی خلوص نمونه هایی مانند پروتئین ها و اسیدهای نوکلئیک را ارزیابی کنند.

      برای هر آزمایشگاهی که با نمونه‌های بیولوژیکی سر و کار دارد، ابزارهای NanoDrop به دلیل سرعت، سادگی و ماهیت قوی، مورد استفاده قرار می گیرند. نانودراپ در آزمایشگاه ژنتیک مولکولی جهت تعیین غلظت اسید های نوکلئيك به کار می رود اما از این دستگاه برای اندازه گیری دانسیته(چگالی) سلول ها و غلظت پروتئین ها استفاده می شود.

      خدمات آزمایشگاهی ژنتیک، کشت سلول، بیوتکنولوژی، میکروبیولوژی

      برای دریافت خدمات مربوط به تعیین میزان غلظت و خلوص اسیدهای نوکلئیک(خوانش OD)

      از طریق لینک خدمات آزمایشگاهی می توانید اقدام نمایید

       

      اسپکتروفتومتر نانودراپ شامل مدل های uv-vis و فلورسانس می باشد.

      مدل های uv-vis شامل: NanoDrop 2000 ،NanoDrop 2000c ،NanoDrop one ،NanoDrop one c.
      مدل های فلورسانس شامل: NanoDrop 3300

      اساس کار شکست نور و محاسبات حاصل از بررسی ضرایب شکست نور در محیط مایع برای مواد گوناگون به ویژه اسیدهای نوکلئیک و پروتئین ها می باشد.

      کاربردهای نانودراپ(Nanodrop applications)

      • توانایی آن در اندازه گیری CyDye واقع شده به درون پروب های ریز آرایه
      • مورد استفاده برای بررسی کیفیت پروب
      • روشی استاندارد در محیط آزمایشگاهی
      • قابلیت آنالیز تعداد بالایی از نمونه ها در یک بازه ی زمانی نسبتا کوتاه
      • توانایی اسکن نمونه ها در سراسر طیف ۲۲۰ تا ۷۵۰ نانومتر
      • سهولت برای اندازه گیری DNA و RNA

      دستگاه نانودراپ

      بیشتر بخوانید:

      • تعیین میزان غلظت و خلوص اسیدهای نوکلئیک

       

      نکته ای که باید در نظر گرفته شود این است که DNA و RNA هر دو در 260 نانومتر جذب می شوند. بنابراین، اگر یک نمونه RNA دارید که تحت تاثیر DNase قرار نگرفته است، غلظت آن ممکن است تحت تأثیر DNA آلوده قرار گیرد. تنها راه برای بدست آوردن قرائت دقیق در این مورد استفاده از روش های فلورمتری مانند کیوبیت است که می تواند به طور خاص کمیت اسیدهای نوکلئیک را تعیین کند.

      دلیل اصلی استفاده از نانودراپ، استنباط خلوص نمونه ها است. که به طور کلی در دو نسبت نشان داده شده است: 260/280 و 260/230. این اعداد مربوط به جذب در طول موج های 230، 260 و 280 نانومتر است.

      توجه داشته باشید که منحنی ارائه شده توسط نانودراپ می تواند بسیار آموزنده باشد بنابراین فقط روی نسبت ها تمرکز نکنید. در منحنی باید یک پیک خوب در 260 نانومتر وجود داشته باشد که نشان دهنده وجود اسیدهای نوکلئیک است و هیچ قله ای در جای دیگر وجود ندارد. اگر پیک های دوگانه یا جابجایی در منحنی وجود داشته باشد، اینها علائم هشدار دهنده حیاتی هستند که نشان می دهد نمونه خالص نیست.

      نسبت 260/280

      نسبت 260/280 نشان دهنده میزان خالص بودن نمونه از آلودگی پروتئینی است. از آنجایی که پروتئین ها در 280 نانومتر جذب می شوند، نسبت کم 260/280 نشان دهنده وجود مقادیر بالای پروتئین نسبت به اسیدهای نوکلئیک است.

      نسبت بهینه 260/280

      نسبت بهینه 260/280 به نوکلئیک اسیدی که اندازه گیری می کنید بستگی دارد:

      DNA: 1.80
      RNA: 2.00

      دلیل اینکه نسبت RNA خالص کمی بیشتر از DNA است، افزایش حضور بازهای اوراسیل (U) است. بنابراین، نسبت 260/280 همچنین می تواند نشان دهنده این باشد که کدام اسید نوکلئیک غالب است.

      برای بهبود نسبت های 260/280، بهترین کار این است که به عقب برگردیم و پروتئین های آلوده را حذف کنیم. بنابراین، استفاده بیشتر از آنزیم های پروتئیناز K و انکوباسیون در طول شب می تواند کمک کننده باشد. پس از تمیز کردن مجدد نمونه ها، نسبت 260/280 ممکن است درست شود، اما ممکن است مقداری از اسیدهای نوکلئیک را از دست بدهیم. از طرف دیگر، اگر نمونه دارای غلظت کمی از اسیدهای نوکلئیک برای شروع باشد، شاید بهتر باشد به منبع (به عنوان مثال سلول ها، بافت) برگردید و کل نمونه را مجدد استخراج کنید.

      نسبت 260/230

      نسبت 260/230 مقداری است که نشان دهنده خلوص نمونه از نمک ها و سایر آلاینده هایی است که می توانند در 230 نانومتر جذب شوند. نمونه هایی از این آلاینده ها عبارتند از EDTA، فنل و گوانیدین هیدروکلراید.

      نسبت بهینه 260/230

      نمونه های اسید نوکلئیک خالص دارای نسبت 260/230 2 یا بالاتر هستند. هر چیزی کمتر از 2 نشان می دهد که عوامل دیگری در نمونه وجود دارد.

      اگر نسبت 260/230 کم باشد، بهتر است نمونه ها را با استفاده از ستون های چرخشی یا رسوب دهی مجدد تمیز کنیم. افزودن مراحل شستشوی بیشتر در طول این فرآیندها می تواند به حذف آلودگی ها کمک کند. با این حال، انجام این کار همچنین می تواند منجر به از دست دادن مقداری اسید نوکلئیک شود. اما، از دست دادن مقدار کمی برای نمونه های خالص ارزش آن را دارد.

      nanodrop

      آلاینده های موجود در نمونه های اسید نوکلئیک

      پروتئین یک آلاینده قابل توجه و اغلب در آماده سازی اسید نوکلئیک است. پروتئین به جذب در 260 نانومتر کمک می کند و به طور مصنوعی غلظت اسید نوکلئیک را افزایش می دهد و با توجه به کاهش نسبت خلوص 260/280 شناسایی می شود.

      شکل 1. DNA خالص و طیف پروتئین خالص روی یک نمودار قرار گرفته اند. طیف DNA (سبز آبی) دارای پیک مشخص در 260 نانومتر و فرورفتگی در 230 نانومتر است، در حالی که، طیف پروتئین (قرمز-آبی) دارای پیک مشخص در 280 نانومتر و افزایش جذب زیر 250 نانومتر است.

      کاهش این نسبت به دلیل وجود بقایای اسید آمینه (تیروزین، تریپتوفان و فنیل آلانین) و پیوندهای دی سولفید سیستین در پروتئین در طول موج 280 نانومتر جذب می شود (شکل 1).

       

      خوانش یا تعیین OD با نانودراپ و تفسیر نتایج

      در تفسیر نتایج نانودراپ مهم ترین عوامل موثر به شرح زیر است:

      آلودگی با پروتئین

      غلظت 260 به 280 پائین تر از 1/8 عموماً نشان دهنده آلودگی پروتئین در طی مراحل استخراج می باشد. یکی از مشکلات در استخراج RNA و DNA حذف ناکامل پروتئین ها از عصاره سلولی می باشد. پروتئین جذب در طول موج 280 را افزایش می دهد، بنابراین نسبت 260 به 280 کاهش می یابد و خلوص RNA کمتر می شود.

      آلودگی با پلی ساکارئید ها

      برای نمونه های RNA و DNA نسبت 260 به 230 باید بالاتر از 2 و کمتر از 2/4 باشد. نسبت 260 به 230 پایین تر نشان دهنده آلودگی به پلی ساکارئید ها می باشد.

      آلودگی با نمک ها

      نسبت جذب 260 به 240 برای اسیدهای نوکلئیک خاص باید حدود 1/4 باشد، این نسبت برای تعیین مقدار نمک ها به کار می رود. وقتی نسبت جذب 260 به 240 کمتر از 1/4 باشد، اسیدهای نوکلئیک باید چند بار با اتانول 70 درصد و در نهایت با اتانول 95 درصد شستشو شوند.

       

      بیشتر بخوانید:

      • دستگاه ها و تجهیزات آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
      • NanoDrop Microvolume Quantitation of Nucleic Acids
      برچسب ها: CuvetteCyDyeOptical Densityآزمایشگاه ژنتیکآنزیم های پروتئیناز Kاجاره تجهیزات آزمایشگاه ژنتیک مولکولیاجاره فضای آزمایشگاهیاسپکتروفتومتریاسیدهای نوکلئیکانکوباسیوندوره آموزشی ژنتیک مولکولیژنتیک مولکولیکارآموزی ژنتیک مولکولینانودراپ
      پست قبلی

      کاربرد و نحوه کار با هات پلیت آزمایشگاهی

      پست بعدی

      طراحی پرایمر با نرم افزار gene runner

      مدیر سایت

      مدیر سایت

      پست بعدی
      طراحی پرایمر با نرم افزار gene runner

      طراحی پرایمر با نرم افزار gene runner

      دیدگاهتان را بنویسید لغو پاسخ

      نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

      وبلاگ داروینو

      کلیه حقوق برای وبسایت داروینو محفوظ است.

      دسترسی سریع

      • وبسایت داروینو
      • درباره ما
      • تماس با ما

      ما را دنبال کنید

      بدون نتیجه
      مشاهده همه نتیجه
      • وبسایت داروینو
      • صفحه اصلی
      • بلاگ
        • ژنتیک
        • میکروبیولوژی
        • کشت سلول و بافت‌شناسی
        • علوم آزمایشگاهی
        • بیوتکنولوژی
      • داروینو پلاس
        • معرفی شخصیت و آزمایشگاه
        • خبرهای علمی و پزشکی
        • معرفی سایت و نرم افزار

      کلیه حقوق برای وبسایت داروینو محفوظ است.

      خوش آمدید!

      ورود به حساب کاربری خود در زیر

      رمز عبور را فراموش کرده اید؟ ثبت نام

      ایجاد حساب جدید!

      پر کردن فرم های زیر برای ثبت نام

      تمام زمینه ها مورد نیاز است ورود

      رمز عبور خود را بازیابی کنید

      لطفا نام کاربری یا آدرس ایمیل خود را برای تنظیم مجدد رمز عبور خود وارد کنید.

      ورود