سیتوژنتیک – تکنیک هیبریداسیون درجای مقایسه ای ژنوم (CGH)

✍ هیبریداسیون درجای مقایسه ای (CGH) روی سلول های متافاز

هیبریداسیون درجای مقایسه ای (CGH)، روشی است که به جای استفاده از یک کاریوتایپ استاندارد، از DNA‌ سلول های مورد نظر برای بررسی کروموزومی استفاده می کنند. این رویکرد بویژه در برخی از سرطان ها سودمند است، هنگامی که به جای سلول های در حال رشد، تنها DNA در دسترس  باشد، DNA ی حاصل از نمونه مورد نظر (مثلا DNA ی تومور)، با یک رنگ و DNAی حاصل از کنترل طبیعی با رنگ متفاوتی نشاندار می گردد. این دو در نسبت مساوی، با کروموزوم های متافازی حاصل از یک کنترل طبیعی هیبرید می شوند. زمانی که مقادیری مساوی از مواد ژنتیکی وجود داشته باشد، هیبریداسیون برابر DNA ی کنترل و بیمار، یک نسبت ۱:۱ را خواهد داد؛ اگر بدست آوردن مواد (ژنتیکی) در نمونه ی مورد نظر وجود داشته باشد، نسبت به سمت رنگ بیمار متمایل می شود و در صورتیکه از دست رفتن مواد ژنتیکی در نمونه بیمار وجود داشته باشد، به سمت رنگ کنترل متمایل می شود.

این فن آوری به طور موفقیت آمیزی برای بررسی بالینی استفاده شده، بخصوص در مواردی که دارای شاخص میتوزی کم (یا فاقد آن) بودند. به هرحال، این فن آوری به علت قدرت تفکیک حدود Mb ۱۰_۲۰  محدودیت دارد و برای تشخیص بازآرایی های متعادل مفید نیست.

کاربردهای تکنیک CGH

  • برای تشخیص حذف و اضافه شدن های تعداد نسخه ها
  • برای غلبه بر مشکلات گستره متافازی
  • برای تشخیص یا تست تومورهای جامد مورد استفاده قرار می گیرد

 در این تکنیک، معمولا از دو رنگ استفاده می کنند:

  • رنگ FITC ،که DNA کنترل طبیعی را به رنگ قرمز مشخص می کند.
  • رنگ DAPI که DNA تست یا تومور را به رنگ سبز مشخص می کند.

تغییرات شناسایی شده با CGH ممکن است بدین ترتیب نوشته شوند:

ish cgh del(12) (q24.3qter)

این اختصارات به معنای یک حذف در بازوی بلند کروموزوم ۱۲ با CGH  است.

 

Internet free icon تکنیک هیبریداسیون مقایسه ای ژنوم بر پایه آرایه ها (Array CGH)